Andoain está situado donde comienza el ensanchamiento del Valle del Oria, situado al pie de los montes Belkoain.
El núcleo urbano de Andoain está surcado por numerosas alturas, entre las que destacan al NO., el Buruntza (439 m.), Belkoain (488 m.) y al SO., Usobelartza (647 m.) y el monte Aizkorri (598 m.), éste ya limitando al Sur, donde comienza a ascender el terreno hacia el monte Adarra (817 m.).
Los ríos principales de Andoain son el Leitzaran y el Oria. El primero viene desde Navarra en un valle estrecho y encajonado. El Oria atraviesa el término municipal de Norte a Sur. El término está regado por arroyos y regatas que descienden de las zonas altas para ir a engrosar las aguas de los dos ríos principales.
Hay que destacar un accidente tectónico de importancia dentro del terreno municipal: la llamada escama caliza del Buruntza.
El clima sigue las líneas generales de la provincia de Gipuzkoa, siendo un clima templado oceánico húmedo, con precipitaciones constantes durante todo el año. Aunque no es un municipio costero, al estar situado en el comienzo del ensanchamiento del Valle del Oria y muy cerca ya de la depresión sublitoral gipuzkoana, recibe las influencias del mar, notando una mayor suavidad en las temperaturas. Las temperaturas son moderadas sin producirse grandes oscilaciones de meses calurosos a meses fríos.
DISTANCIAS:
S. Sebastián, NI 15 km.
Bilbao, A-8 99 km.
Pamplona-Iruñea, A-5 61 km.
Vitoria-Gasteiz, NI 91 km.
